El Decreto 174/2003, de 22 de julio, de organización y funcionamiento del sistema de Archivo de la Administración Pública de la CAE, dió cobertura legal a un sistema que llevaba funcionando desde comienzos de los años ochenta, coincidiendo con la constitución del primer Gobierno Vasco.

El Archivo General comparte sede y recursos humanos y materiales con la Biblioteca General y el Servicio Central de Publicaciones, adscritos a la Dirección de Recursos Generales del Departamento competente en Administración Pública.

Desde el año 1982, fecha en que comenzaron las primeras transferencias de documentación, el Archivo General siempre ha estado próximo a su principal usuario - La Administración Vasca - y ha ido creciendo a la par que ésta. Inicialmente estuvo instalado en las plantas baja y sótano del edificio de la calle Duque de Wellington de Vitoria-Gasteiz.

A partir de 1997, se trasladó al nuevo edificio de la calle Donostia-San Sebastián, ocupando parte de la planta baja, primer y segundo sótano. No obstante, hasta el año 2010 se mantuvo la contratación de un servicio de custodia externa iniciado en el año 1992.

En 2010, con la construcción del nuevo edificio de depósito de archivo se puso fin a esta situación y el Archivo General ya cuenta con suficiente infraestructura para dar un servicio completo de custodia, conservación y consulta.

El nuevo edificio de depósito de archivo, obra del arquitecto Iñaki Aspiazu (1954-2014), ubicado también en Vitoria-Gasteiz y ocupa una parcela de 9.582 metros cuadrados, con una superficie de edificación de 6.011 m².

Se trata de un gran centro de logística donde todo el servicio está automatizado y en el que dos robots recorren sus pasillos guiados por un programa informático que optimiza recorridos y gestiona la ubicación de las cajas de documentos.

Para conocer las características de este edificio se recomienda la visita virtual:

La Ley 5/2023, de 23 de junio, de Gestión Documental Integral y Patrimonio Documental, cambió la denominación del Sistema, que pasó a llamarse Sistema de Archivo del Sector Público de la Comunidad Autónoma del País Vasco.