En este ámbito se pretende la consecución de un sistema aeroportuario vasco con una gestión más cercana, integrada y coordinada de los aeropuertos vascos, y con la conexión de las infraestructuras aeroportuarias con el conjunto del sistema de transporte.

Para ello Euskadi está dotado con excelentes infraestructuras aeroportuarias para el transporte de viajeros y de mercancías situados en las inmediaciones de Vitoria-Gasteiz, Bilbao y Donostia-San Sebastián.

El aeropuerto de Foronda posee unas infraestructuras que permiten las operaciones de las mayores aeronaves y un alcance intercontinental; asimismo dispone de vuelos regulares de mercancías que le sitúan en los primeros puestos de los aeropuertos del Estado en transporte de mercancías, así como de conexiones regulares y chárters de viajeros.

El aeropuerto de Hondarribia dispone de vuelos regulares de pasajeros con las principales ciudades del Estado y conexiones estacionales con destinos internacionales. Cuenta con un hinterland tractor importante desde el punto de vista turístico y de un cierto carácter logístico derivado de su localización transfronteriza.

El aeropuerto de Loiu es el más importante de la cornisa cantábrica, con un elevado número de conexiones regulares de pasajeros con ciudades del Estado e internacionales. Además cuenta con un hinterland demográfico, industrial y logístico potente.