El 18 de enero de 2006 se adoptó el Reglamento (CE) Nº 166/2006 del Parlamento Europeo y del Consejo relativo al establecimiento de un Registro Europeo de Emisiones y Transferencias de Contaminantes y por el que se modifican las Directivas 91/689/CEE y 96/61/CE”. El PRTR Europeo (E-PRTR) tiene por objeto aplicar a nivel comunitario el Protocolo CEPE/ONU PRTR, que fue firmado por la Comunidad Europea y 23 Estados Miembros en mayo de 2003 en Kiev en el marco de la Convención Aarhus. El E-PRTR sustituye al Inventario Europeo de Emisiones Contaminantes (EPER) en virtud del cual se comunicaron los datos correspondientes a los años 2001 y 2004.

Desde el año 2002 el Departamento de Medio Ambiente y Política Territorial ha gestionando el reporte de los datos E-PRTR de los centros operativos afectados por dicha normativa en la Comunidad Autónoma de Euskadi a través del servicio de la Declaración Medioambiental electrónica notificación (e-DMA) del Sistema IKS eeM, garantizando con ello, además del cumplimiento del requisito normativo, la fiabilidad y coherencia de la información reportada en aras a salvaguardar la calidad y fiabilidad de la misma, para su posterior publicación de acuerdo, entre otros, con las prescripciones de la Ley 27/2006 de 18 de julio por la que se regulan los derechos de acceso a la información, de participación pública y de acceso a la justicia en materia de medio ambiente en cumplimiento del Convenio de Aarhus.